Mökkisaunan puhdistuksessa on suositeltavaa käyttää biohajoavia pesuaineita tai höyrypesuria, jotta kemikaaleja ei päädy ympäröivään luontoon. Koti Puhtaaksi Oy:n toimitusjohtaja Reetta Alastalon mukaan saunan perusteellinen pesu tulisi suorittaa vähintään kahdesti vuodessa. Yleisimmät ajankohdat suursiivoukselle ovat juhannuksen ja joulun alla.

Puhdistukseen soveltuvat miedot yleispesuaineet, mäntysuopa tai ruokasooda. Alastalo varoittaa käyttämästä klooripitoisia aineita, sillä ne voivat imeytyä puuhun ja vapautua myöhemmin saunan lämmössä. Myös muiden pesuaineiden laimentaminen on tärkeää, jotta ne eivät jää puun huokosiin ja höyrysty saunojien hengitysilmaan.

Saunan pesu onnistuu tarvittaessa myös järvi- tai merivedellä, jos vesi on kirkasta. Alastalo muistuttaa, että meriveden käytön jälkeen lauteet on huuhdeltava makealla vedellä. Muutoin suolakiteet voivat jäädä puun pinnalle, imeä kosteutta ja aiheuttaa vaaleita läikkiä tai puumateriaalin vaurioitumista.

Kiuaskivien huolto on myös osa saunan puhdistusta. Kivet tulisi tiedotteen mukaan pestä pelkällä vedellä erillään kiukaasta. Samalla on syytä tarkastaa kivien kunto ja vaihtaa murentuneet kivet uusiin. Saunan yleistä siisteyttä voi ylläpitää käyttämällä laudeliinoja ja huolehtimalla saunan kuivatuksesta käytön jälkeen.